在生活中水的應(yīng)用非常廣泛，而現(xiàn)在水質(zhì)的問題日趨嚴重。想要了解水質(zhì)變化的具體情況，檢測水中微生物是一種比較直觀的方法，因為水污染產(chǎn)生的大量有機物質(zhì)能培養(yǎng)處各種微生物。
另外生活中如果無法對水中微生物進行有效檢測，就會造成一些健康問題。尤其是一些食品行業(yè)，水中微生物的來源有很多種，其中主要來源于人或動物糞便污染的水體，從而引起可能導(dǎo)致腸道傳染病的傳播，造成更大的健康隱患，另外水體中微生物過多是也會造成藻類大量生長，造成水中氧氣量不足,導(dǎo)致魚蝦因缺氧死亡。因此要定時的對水中微生物進行檢測。
水質(zhì)常規(guī)微生物指標要求：
| 微生物檢測指標 | 限值 | |
| 總大腸菌群（MPN/100mL或CFU/100mL） | 不得檢出 | |
| 耐熱大腸菌群（MPN/100mL或CFU/100mL） | 不得檢出 | |
| 大腸埃希氏菌（MPN/100mL或CFU/100mL） | 不得檢出 | |
| 菌落總數(shù)（CFU/mL） | 100 | |
| 隱孢子蟲/(個/10L) | <1 | |
檢測水中的微生物首先要進行取樣，這樣才能獲得水體的一些基礎(chǔ)數(shù)據(jù)，采樣的時候要提前根據(jù)檢測目的和任務(wù)指定計劃，具體的取樣方法包括采樣目的、檢驗指標、采樣時間、采樣地點、采樣方法、采樣頻率、采樣數(shù)量、采樣容器與清洗等。
采樣前應(yīng)先用水樣蕩洗采集器、容器2-3次，如果是在同一個水源采集幾類檢測指標水樣時，應(yīng)先采集供微生物測試的水樣，直接采集時不得用水樣刷洗已滅菌的采樣瓶，而且不得用手指和其他物品對瓶口的污染，另外采樣時不能攪動底層的沉積物。水中微生物的采樣體積一般不超過5L,水樣的保存時間及方法要符合相關(guān)要求。
目前檢測水質(zhì)微生物的主要方法可分為多管發(fā)酵法和酶底物法這兩種，多管發(fā)酵法是使用相應(yīng)的培養(yǎng)液在36攝氏度的環(huán)境中，對采集樣品進行初步發(fā)酵實驗，接著進行平板分離和復(fù)發(fā)酵實驗得到最終的結(jié)果。而酶底物法是利用微生物所產(chǎn)生的β2酶分解產(chǎn)生的物質(zhì)，使培養(yǎng)液所呈現(xiàn)的顏色來確定水中是否含有相應(yīng)的微生物。
其中多管發(fā)酵法的優(yōu)勢在于沒有雜菌污染，微生物檢測結(jié)果相對準確，而酶底物法的優(yōu)勢在于操作簡單，對于環(huán)境要求不高，檢測范圍相對較廣以及時間短等優(yōu)勢。
